Конец 60-х годов XX века. Япония, оправившись от последствий Второй мировой войны, переживает бурный экономический рост. В то же время неизвестные враждебные силы, известные как Захватчики, начали проводить по всему миру ряд нападений на различные объекты. Для борьбы с ними была создана специальная секретная международная организация — A.E.G.I.S. (Alien Extermination Global Intercept System — Глобальная Система Обнаружения и Уничтожения Пришельцев, по-английски слово aegis также означает эгида, защита или охрана).
Бороться с врагами при помощи обычного оружия было фактически невозможно и для защиты Земли A.E.G.I.S. стала набирать людей обладающих особыми способностями, так называемых Хранителей Врат.
Хранители могли открывать Врата в другое измерение, черпать оттуда энергию и использовать её в своих целях. Первым Хранителем Восточного Отделения A.E.G.I.S.,штаб-квартира которого была расположена в Японии и замаскирована под здание школы, стала Рурико Икудзава — Хранитель Врат Жизни.©Википедия

Токио, 1969. Земля находится под нападением "Захватчиков". К счастью, общественность не сознает это. Но для организации, A.E.G.I.S, угроза очень реальна, и это - они, кто остановит это вторжение. Однажды по пути к средней школе, Ukiya, наблюдает сражение между молодой девочкой и группой Захватчиков. Он заканчивает тем, что помог ей и обнаруживает, что он также как и девочка обладает способностью вызывать "врата" которой одаренны только несколько людей. В результате Ukiya присоединяется к A.E.G.I.S, чтобы защитить город, прилагая все усилия.