События происходят в недалеком будущем после окончания сериала. Без подробностей, но Акито и Юрику считают безвести пропавшими, или даже погибшими. Война закончилась... Теперь новый Надесико-C занимается патрулированием территорий под руководством нового капитана (бывшего штурамана). Команда без дела не сидит - поле войны как на дрожжах растут и пухнут всякие террористические организации. С одной из таких и предстоит сразиться. Эти террористы оказались очень могущественными, да еще обладают невиданной технологией беспрепятственного перемещения в пространстве чего угодно и куда угодно. И что самое невероятное, это как-то связано с пропавшими Акито и Юрикой.