Много веков назад началась грандиозная и беспощадная битва за господство во Вселенной между двумя расами супер-трансформеров - героическими Автоботами и злобными Дисептиконами. Их силы были примерно равны, и никто не мог одержать окончательной победы. Однако неожиданно в этой войне появилась третья сторона - "зеленая армада" трансформеров Мини-Конов, способных нарушить сложившееся равновесие сил. Теперь исход сражения зависит от того, чьим союзником станут Мини-Коны...

Командный космический корабль Мини-Конов, попав в черную дыру, теряет управление и падает на планету Земля... Четыре миллиона лет спустя трое подростков, исследуя загадочную пещеру, находят обломки корабля и нечаянно активируют его передатчик. Эти сигналы принимают Автоботы и Дисептиконы и отправляют на поиски Мини-Конов своих лучших бойцов. Битва за судьбы Вселенной качнется на нашей планете!