Много веков назад началась грандиозная и беспощадная битва за господство во Вселенной между двумя расами супер-трансформеров - героическими Автоботами и злобными Дисептиконами. Их силы были примерно равны, и никто не мог одержать окончательной победы. Однако неожиданно в этой войне появилась третья сторона - зеленая армада трансформеров Мини-Конов, способных нарушить сложившееся равновесие сил. Теперь исход сражения зависит от того, чьим союзником станут Мини-Коны...

Миниконы, являющиеся основой защитной системы СкайБум, пропадают при загадочных обстоятельствах. Вместе с ними пропадает СтарСкрим, на которого и падает подозрение Автоботов. Спустя некоторое время миниконы находятся, но от СтарСкрима по-прежнему нет вестей и никто не знает, вернулся ли он к Ди-септиконам, или примкнул к какой-то третьей стороне. Тем временем, пока Автоботы переживали предательство СтарСкрима, и их моральный дух не так высок как прежде, Мегатрон воспользовался моментом и испытал свое новое оружие. Удовлетворенный результатами, он решает, что время решающей битвы пришло, и вновь направляет свой взор на Землю.