Много веков назад началась грандиозная и беспощадная битва за господство во Вселенной между двумя расами супер-трансформеров - героическими Автоботами и злобными Дисептиконами. Их силы были примерно равны, и никто не мог одержать окончательной победы. Однако неожиданно в этой войне появилась третья сторона - "зеленая армада" трансформеров Мини-Конов, способных нарушить сложившееся равновесие сил. Теперь исход сражения зависит от того, чьим союзником станут Мини-Коны...

В пучинах океана команда автоботов нашла руины древней высокоразвитой цивилизации. По найденным записям Рад, Карлос и Алексис смогли восстановить историю мини-конов здесь, на Земле. Оказывается, именно благодаря мини-конам эти люди открыли для себя секреты невиданной энергии и технологий будущего. Как и ожидалось, люди обратили эти знания себе во вред. Стар Сэйбер, результат слияния трех мини-конов, превратился в грозное оружие, вместо того чтобы служить миру и прогрессу. Освобожденная энергия разрушения уничтожила все на своем пути, лишь немногим выжившим удалось спастись. И теперь Мегатрон ищет одного из этих трех мини-конов, чтобы возродить Стар Сэйбера к жизни.