Команда тайных агентов ЦРУ под руководством Джима Фелпса проводит сложную операцию в Праге. Они пытаются завладеть дискетой с секретной информацией. Эти данные также интересуют мафию. Тщательно продуманная операция неожиданно проваливается и часть спецагентов погибает. В живых остался только один - Итан Хант. Руководство ЦРУ возлагают вину за провал на него. Но агент осознает, что это все словно по нотам разыгранная операция. Итан решает сам найти злополучную дискету и разоблачить заговор, нити которого ведут прямо к высокопоставленным лицам правительства.