Гражданская война между выжившими людьми и разумными приматами, начатая Кобой, в самом разгаре. На этот раз Цезарь и его присные вынуждены бороться за выживание с безжалостным Полковником, засевшим с остатками армейских подразделений в местном концлагере для мартышек. Сюда же примешиваются и личные мотивы, когда Полковник убивает из именного нагана жену и старшего сына Цезаря. Вожак обезьяннего племени должен решить непростую нравственную дилемму: отомстить убийцам своей семьи и тем самым уподобиться Кобе-предателю или все-таки понять и простить, попутно отыскав новый дом для всех обезьян.